纽约州立大学石溪分校位于纽约长岛，学校处于纽约市东面，距离曼哈顿地区很近，而且学校的学术氛围很好，毗邻世界生命科学的圣地冷泉港实验室，并有长期合作。除此之外纽约州立大学石溪分校还管理有临近的著名的布鲁克黑文国家实验室。学校还拥有单独的医疗中心。纽约州立大学石溪分校所处的长岛气候宜人，四季分明，校园内绿树环绕，环境幽雅，而且距离纽约很近，交通便利，很方便。